¿La función de guardar medios entrantes de Whatsapp crea duplicados?

Sí, duplica los medios de comunicación en el sentido que usted describe. Con ese interruptor activado, todas las imágenes entrantes tendrán 2 copias: una en la aplicación y otra en el Camera Roll.

Respondiendo a tu comentario, no tanto la capacidad de auto-borrado, sino que al desactivarla se evita que se copie en Camera Roll - tendrás que borrar manualmente el mensaje para poder eliminar el medio.