Este es un claro problema con las copias de seguridad para portátiles. Quieres portabilidad y no quieres esperar horas a que termine una copia de seguridad.
En primer lugar, matar los procesos de copia de seguridad mientras se están ejecutando puede resultar en archivos de copia de seguridad corruptos: arrancar la unidad puede dañar la propia unidad mecánica causando la pérdida de todo el volumen.
¿Cuántos datos crea cada día? Una vez creada la primera copia de seguridad de todo el almacenamiento, sólo debería añadir el delta (archivos modificados) cada hora.
¿Esto es en casa, antes de salir a trabajar? Tu mejor opción es hacer una copia de seguridad en un dispositivo de almacenamiento en red en tu red inalámbrica. Lamentablemente, Apple acaba de eliminar sus productos Time Capsule, pero cualquier caja NAS debería funcionar. Incluso puedes conectar esa unidad a tu router, si tiene ranuras USB, aunque tendrás que reformatearla a NTFS.
Otra alternativa es utilizar el almacenamiento en la nube como estrategia de copia de seguridad.
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Hace
diskutil unmount "/Volumes/NameOfDisk"
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Time Machine no debe estar funcionando cuando quieras expulsar la unidad.
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Configurar un temporizador para que la máquina del tiempo se detenga antes de que te despiertes.