En cada arranque, OSX 10.8 comprueba siempre la base para ciertas aplicaciones (Launchpad, Appstore, Recordatorios, Notas, etc.), y se agregan a la base si que han sido retirados. (Ni idea de por qué-esto parece extraño y molesto para mí, también.)
La solución es modificar el sistema de archivo plist (/Library/Preferences/com.apple.dockfixup.plist), la eliminación de los elementos de configuración que definen estas "correcciones". Para modificar este archivo, usted necesitará privilegios de administrador--TextWrangler debe pedirá automáticamente que usted, cuando usted empezar a cambiar las cosas.
En el plist de archivo, busque la opción "agregar aplicación" clave, que debe ser seguido inmediatamente por un elemento, que contiene varios elementos:
<key>add-app</key>
<array>
<dict>
...
</dict>
<dict>
...
</dict>
...
</array>
Usted puede eliminar selectivamente sólo los elementos para determinadas aplicaciones, o puede eliminar a todos ellos.
Después de guardar los cambios, usted todavía tendrá que quitar manualmente el ofender a los iconos del dock. Sin embargo, en el futuro se reinicia, el sistema no va a agregar automáticamente las aplicaciones de nuevo al muelle. (Siempre puedes agregarlos manualmente, si lo desea).