Probablemente no existe un "ajuste esta opción en" la forma de hacerlo, pero me he dado cuenta de que.) el número de mensajes no leídos es el número de mensajes no leídos en la bandeja de entrada, no en subcarpetas y b.) iOS no comprueba automáticamente las subcarpetas para los mensajes nuevos a menos que esas subcarpetas se establece para impulsar, a través de Exchange. Por lo tanto, si su cuenta es una cuenta de Exchange:
-Hacer una subcarpeta en tu Bandeja de entrada
-Crear una regla de servidor para mover todos los mensajes de esa carpeta. Esto se puede hacer en Outlook en su equipo de trabajo (asumiendo que es un PC) o probablemente en el cliente web de Exchange (lo que posiblemente requiera de IE, ya que deshabilite la funcionalidad en el cliente web para otros navegadores...).
A continuación, usted todavía tiene acceso a los mensajes de la cuenta de trabajo (+1 toque, pero es un iPhone 4, así que es ágil), y que no se mostrará en su número de mensajes no leídos.