¿Es posible programar la ejecución de las reglas de Mail.app?

Así es como yo enfocaría esto - ten en cuenta que es bastante técnico y se recomienda sólo a las personas que saben lo que están haciendo.

1) Escriba un script de Apple para enviar la pulsación de teclas para aplicar sus reglas definidas en Mail.app

2) Programar un crontab para que ejecute ese script a horas predeterminadas

Para empezar aquí hay un ejemplo de script que he escrito:

tell application "System Events"
tell application "Mail" to activate
keystroke "l" using {command down, option down}
end tell

A continuación, para programar su trabajo (por ejemplo, la medianoche) mediante la adición de una entrada crontab - cambiar el nombre de usuario al usuario que está ejecutando Mail.app como - dejar osascript como es

* 0 * * * username osascript 'path to your script.scpt'

Alternativamente, utilice una interfaz gráfica de usuario para programar lo anterior, como cronnix http://code.google.com/p/cronnix/