Fúndalos en una sola biblioteca ( Administrador de la biblioteca de iPhoto hará este trabajo), y luego subirlas a iCloud designando la biblioteca combinada como Fototeca del Sistema en las preferencias de Fotos, después de abrirla y convertirla con Fotos.
Otra forma de fusionar dos o más bibliotecas se describe en el sitio de Apple: https://support.apple.com/en-us/HT204414
Si designa una nueva biblioteca como Fototeca del Sistema y luego activar la Fototeca de iCloud, las fotos y vídeos de la nueva biblioteca se fusionarán con los que ya están en tu Fototeca de iCloud. Si usted quieres mantener el contenido de tus fototecas por separado, no actives la Fototeca de iCloud para más de una biblioteca en Fotos.
Dependiendo de la velocidad de carga, prepárate para una espera muy larga.
Y si entonces/después lo quieres en tu MacBook haz una nueva fototeca vacía en tu disco duro interno y selecciónala como "Fototeca del sistema", activa la fototeca de iCloud y ponla en optimizada. Entonces descargará los originales o las versiones optimizadas, dependiendo del espacio disponible.