La respuesta corta es no. Los buzones inteligentes son básicamente filtros. Todo el correo se encuentra todavía en el buzón original. O como Apple pone:
Un Buzón de correo Inteligente muestra en una ubicación mensajes que están almacenados en otros buzones. Por ejemplo, un Buzón de correo Inteligente podría mostrar todos los mensajes de un remitente específico o con un determinado tipo de archivo adjunto, independientemente de que el buzón de correo donde se almacenan.
Fuente.
Usted podría, sin embargo, crear su propia clase de los buzones inteligentes mediante el uso de reglas para mover los mensajes alrededor de la base de ciertas características. http://support.apple.com/kb/PH11738.
Ejemplo de reglas de creación de una carpeta:
Esto mueve todo el correo de hoy a una carpeta que se llama hoy en día. Un día más tarde, se trasladará el correo a una carpeta con el nombre de archivo (archief en holandés). Esto debe darle una idea de cómo trabajar con reglas y carpetas.