Si selecciono una fuente árabe como Kufi (كوفي) e introduzco el texto en GIMP 2.8.14 en OS X 10.11, este es el resultado:
Como puede ver, las letras están incorrectamente desarticuladas.
Si hago clic con el botón derecho en el texto y selecciono "De derecha a izquierda", no hay diferencia. En las opciones de la herramienta de texto, puedo cambiar el idioma de inglés a árabe, pero no hay diferencia. También puedo cambiar la justificación a centrado o alineado a la izquierda, pero no hay diferencia.
Algunas fuentes que selecciono sí que se representan con las letras conectadas, pero parece que simplemente está utilizando una fuente de reserva.