¿Hay alguna manera de saber de un vistazo cuántas ventanas están abiertas para una aplicación?
En el dock, usando El Capitán, aparece un punto negro debajo de los iconos de las aplicaciones en ejecución, pero si las ventanas están una encima de la otra (es decir, la ventana principal de Chrome, y la ventana emergente de Gmail de Chrome componiendo un nuevo correo), parece que no hay manera de saberlo sin hacer un Exposé de la aplicación.
Yo diría que la forma más rápida es hacer clic con el botón derecho/mantener pulsado el icono del dock. Esto abre un menú, donde puedes ver todas las ventanas abiertas, incluso las que están en pantalla completa, que no aparecen en App Exposé. Como este menú puede llegar a ser bastante largo, lo mejor es buscar la sección con el icono 
en cada línea, y una marca junto a uno de los elementos. El número de veces que aparece este icono representa el número de ventanas de esta aplicación actualmente abiertas.
Aquí hay dos ejemplos de este menú para diferentes aplicaciones:
Terminal (2 ventanas abiertas)
Páginas (3 ventanas abiertas)
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