En mi opinión, la forma correcta es establecer tu ruta para preferir tu instalación de PHP.
- Apple restringe PHP, por lo que no puedes eliminarlo sin evitar la protección de integridad del sistema
- Apple actualizará esos archivos en cualquier momento que desee, por lo que siempre necesitarás volver a hacer lo que sea necesario para modificar el sistema
- Si creas un entorno virtual como docker o simplemente usas rutas correctas para tu instalación, estos son portátiles y no requieren ningún tipo de trabajo adicional.
Si realmente necesitas eliminar esos archivos, deberás arrancar en recuperación HD y desactivar SIP. Luego, eliminar todos los archivos y bibliotecas asociadas (con el potencial de romper herramientas de Apple si eliminas algo que el sistema realmente ejecuta en algún momento) y luego volver a habilitar SIP según sea necesario. Haría una buena copia de seguridad antes de cambiar SIP, por si acaso deseas recuperar el sistema después de borrar cosas.