Los datos de Launchpad se almacenan en una base de datos SQLite 3 ubicada en:
$HOME/Library/Application Support/Dock/UUID_Type_Filename.db
Ejemplo: 3BF614D8-048E-344B-9775-AA8ED64B3564.db
Que puedas o no editarlo con éxito depende de tus conocimientos de SQL.
Siempre puedes borrar el archivo, probablemente mejor desde el Recovery HD, y se reconstruirá cuando vuelvas a entrar y abrir el Launchpad. También puede intentar borrarlo y luego en la Terminal ejecutar el comando killall Dock
y luego abra Launchpad. Debería reconstruirse sólo con las aplicaciones actualmente instaladas.
Otra cosa a considerar es que tal vez reconstruir la base de datos de los servicios de lanzamiento pueda ayudar. Nota: Reconstruir la base de datos de servicios de lanzamiento puede eliminar algunas personalizaciones que haya hecho y tendría que establecerlas de nuevo.
En una terminal:
/S*/L*/F*/C*/F*/L*/S*/lsregister -kill -r -domain local -domain system -domain user
Sugerencia: Copie y pegue el comando anterior en el Terminal para evitar errores tipográficos.
La ruta completa es:
/System/Library/Frameworks/CoreServices.framework/Frameworks/LaunchServices.framework/Support/lsregister
Aunque puede utilizar la versión con comodín, no necesita la versión con nombre de ruta completo para que se ejecute.