Script de Shell fallando en Automator pero funciona si lo copio/pego en Terminal

Probablemente hayas personalizado la variable de entorno del camino de búsqueda de comandos PATH para localizar convert porque no está instalado en una ubicación estándar de OS X.

Cuando la acción de script de shell de Automator ejecuta un script, utiliza un shell no interactivo, lo que significa que no ejecuta archivos como ~/.bashrc o ~/.bash_profile. Esto significa que utiliza el entorno y el camino de búsqueda de comandos predeterminados.

Además, es una buena práctica que los scripts de shell utilicen rutas absolutas para los ejecutables de comando para que el script siempre ejecute el que tenías en mente, en lugar de depender del camino de búsqueda, que está principalmente diseñado para ser una conveniencia para el uso interactivo del shell. Para descubrir la ruta absoluta del comando convert, ejecuta which convert en un shell.

@Chris Page ofreció una respuesta perfectamente aceptable, porque aborda todos tus problemas necesarios, pero luego eché un segundo vistazo a tu código y me pregunté por qué no usar una función con un bucle en lugar de todos esos comandos de variables?

ink() {
  square_dimension="$2"
  infile="$1"
  /Applications/Inkscape.app/Contents/Resources/bin/inkscape --export-png "${root}/test_${square_dimension}.png" -w ${square_dimension} -h ${square_dimension} "$infile"
}

for i in {256,128,64,48,40,32,24,16}; do ink "$1" "$i"; done

Toma en cuenta que el código anterior no ha sido probado, y no es tu script completo, solo es un fragmento que reemplazará la mayoría de tu código. Lo actualizaré después de haber tenido la oportunidad de probarlo, pero se ve bien para mí. Es posible que necesites exportar la función o algo (export -f ink) o jugar con las variables de argumento, pero como dije, publicaré una actualización después de haber tenido la oportunidad de probarlo.

También, como dije antes, @Chris Page ofreció una respuesta que prácticamente responde tu pregunta. Esta es simplemente información adicional que está mejor formateada como respuesta en lugar de múltiples comentarios.

También, es una buena práctica siempre usar nombres de variables en minúsculas en scripts de shell para no sobrescribir ninguna de las variables de entorno integrada (algo con lo que he luchado, porque las variables son mucho más fáciles de reconocer, especialmente en un script grande en un sistema sin un terminal con color para resaltado de sintaxis).