La página man de cp
dice esto acerca de la -a
opción de:
Mismo como -pPR opciones. Conserva la estructura y los atributos de los archivos, pero no la estructura de directorios.
FreeBSD cp manual no tiene esta advertencia, aunque la estructura de las opciones sigue siendo muy similar, si no idéntica.
Lo que no conservando la estructura de directorios significa en este caso?