Lo he intentado: funciona.
He aquí cómo:
Tengo un volumen de Time Machine y una copia de seguridad del mismo. Actualizo esta copia de seguridad cada dos meses, utilizando Super Duper.
Recientemente, varios errores sucesivos hicieron que mi volumen de Time Machine perdiera sus dos primeros años de copias de seguridad. Entonces tenía un volumen de time machine primario con todas las copias de seguridad menos los dos primeros años y un volumen de time machine de respaldo con todas las copias de seguridad menos los dos últimos meses.
Decidí experimentar. Empezando desde cero en un nuevo disco duro, copié el volumen de la máquina del tiempo de copia de seguridad en el nuevo disco duro con Super Duper (copia de seguridad de todos los archivos utilizando la opción de borrar y guardar). Luego copié el volumen primario de la máquina del tiempo encima, de nuevo con Super Duper (copia de seguridad de todos los archivos, utilizando los archivos de copia que son diferentes).
Terminé con un nuevo volumen de time machine que funciona, incluyendo todas las copias de seguridad, desde el primer día hasta hoy.
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Creo que un "por qué" quieres hacer esto está en orden.
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No se admite oficialmente. Si quieres probar, yo clonaría (copia de seguridad) uno de tus discos de Time Machine, y luego experimentaría.
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Time Machine está usando enlaces duros, yo tendría MUCHO cuidado al tratar de meterse con su almacenamiento interno.
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Conceptualmente es absolutamente posible pensar en un programa que vuelva a hacer el trabajo de configurar la compresión de Time Machine y fusionar ambos. En la práctica, tal herramienta no está disponible públicamente.