El texto de la advertencia es engañosa. Si desactiva esta sincronización, los archivos no se han ido o borrado, pero que no estará en su ~/Escritorio o en tu ~/carpetas de Documentos. Ellos estarán en su "iCloud Drive" de la carpeta, que es una carpeta en tu ordenador que se sincroniza con iCloud. Para hacer las cosas "de vuelta a la normalidad" usted sólo tendrá que mover los archivos de la "iCloud Drive" carpeta ~/Escritorio y ~/carpetas de Documentos.
Aquí es cómo limpiar las cosas:
Primero hay que ir a menú de Apple -> "Preferencias del Sistema" -> iCloud
En las preferencias de iCloud debe hacer clic en el botón "Opciones" junto al elemento de "iCloud Drive" y si el "Escritorio Y Carpetas de Documentos" elemento está seleccionado, a continuación, que es probablemente lo que está causando a usar mucho espacio en computadoras de Apple. Si desactiva esta casilla, usted puede recuperar una gran cantidad de espacio para el almacenamiento de iCloud, pero va a tomar un par de pasos más para que se "vuelva a la normalidad":
Vaya al Menú Apple > Preferencias del Sistema > iCloud > iCloud Drive y Desactive el "Escritorio Y Carpetas de Documentos" casilla de verificación. Obtendrá una ventana emergente de advertencia de que estos archivos solo serán almacenados en iCloud Drive si deshabilitar Escritorio y Documentos de la sincronización. Siga adelante y haga clic en "Desactivar". Archivos en su escritorio y en su carpeta de Documentos parecen ser retirada, pero aún están dentro de la "iCloud Drive" en la carpeta de su equipo, que se abrirá automáticamente después de hacer clic en "Desactivar", por lo que estos archivos no son en realidad de desaparecer y ser eliminado, sino que son simplemente en iCloud Drive exclusivamente.
A continuación, abra el iCloud Drive carpeta en tu Mac y verás dos carpetas llamadas "Escritorio" y "Documentos". Si usted no puede encontrar el "iCloud Drive" de la carpeta (es probable que aparece en una ventana del Finder "barra lateral", que puede ser mostrado usando el Buscador de elemento de menú "Ver" -> "Mostrar barra Lateral" si la barra lateral está oculto), usted puede tener acceso a ella por ir al Buscador de elemento de menú "Finder" -> "Preferencias" -> "barra Lateral" y haciendo que el "iCloud Drive" está marcada.
En "iCloud Drive" es donde los archivos están. Ahora puede mover su contenido a tu ~/Escritorio y tu ~/carpetas de Documentos.
Usted puede dejar la ahora vacía "de Escritorio" y "Documentos" en "iCloud Drive". Si los elimina, se pueden poner recreado automágicamente, así que no se sorprenda.
El siguiente sitio web tiene algunas fotos de las ventanas, así como algunos de los de texto que he copiado más arriba:
http://www.howtogeek.com/273629/how-to-restore-your-desktop-and-documents-after-disabling-icloud-sync-in-macos-sierra/
Esta es otra referencia sobre los temas:
http://www.macworld.com/article/3098804/data-center-cloud/how-to-use-icloud-drive-s-new-desktop-and-documents-access-in-macos-sierra.html