Una solución temporal siempre es simplemente Command - A para seleccionar todas las celdas y haciendo clic en este conveniente botón en la cinta bajo la pestaña Inicio en la sección Número:
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Una solución más permanente es la siguiente:
Ve a Preferencias del Sistema > Idioma y Texto y haz clic en la pestaña "Región". Si el primer menú desplegable de la región es Estados Unidos (ordenador), puede que éste sea tu problema. A continuación se muestra que esta región da formato a los números sin un separador de miles.
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Esto parece ser el resultado, como usted dijo, de una actualización de OS X. En su lugar, establezca la región a Estados Unidos (sin la parte de la computadora).
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Desde la ventana de ayuda de Excel:
Mostrar u ocultar el separador de miles
Selecciona las celdas que quieres ajustar. En la pestaña Inicio, en Número, haga clic en Mostrar el valor de una celda con un separador de miles.
Nota: Excel utiliza el separador del sistema Mac OS para miles de personas. Puede especifican un separador de sistema diferente por cambiar los ajustes regionales en las preferencias del sistema internacional de Mac OS X.
Acabamos de hacerlo, pero parece que Excel sigue ignorando el cambio. Reinstale Office y actualícenos con los resultados.