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Qué software está disponible para 3D, diagramas y gráficos?

Estoy buscando un software para generar bastante 3D, diagramas y gráficos para publicaciones científicas, por ejemplo algo como esto: http://www.123rf.com/photo_9355990_space-fill-ball-and-stick-models-of-methanol.html

Idealmente, el software debe permitir también a mí de alguna manera me permite colocar objetos mediante programación, si me gustaría 100s de las esferas.

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timothymh Puntos 5183

Esto no ayuda con los gráficos, pero para hacer molecular diagramas recomiendo la fuente abierta de Jmol, la cual es gratuita para Windows, Mac y Linux. Permite crear todo tipo de moléculas y exportarlos como los applets de Java, imágenes o animaciones.

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anschauung Puntos 258

Me gustaría utilizar MAPLE para esto, ya que ya tengo. Pero, por supuesto, es que no es baratoTM

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