Estoy buscando un software para generar bastante 3D, diagramas y gráficos para publicaciones científicas, por ejemplo algo como esto: http://www.123rf.com/photo_9355990_space-fill-ball-and-stick-models-of-methanol.html
Idealmente, el software debe permitir también a mí de alguna manera me permite colocar objetos mediante programación, si me gustaría 100s de las esferas.