¿Cómo desactivo la iMessages en OS X?

Como se mencionó en uno de los comentarios ya, dentro de los mensajes ir a Preferences > Accounts y poner de relieve la cuenta iMessage. Allí o desmarque la casilla para activar esta cuenta o signo de iMessage, que efectivamente se desactivará la cuenta.

Suponiendo que la versión de OS X es 10.10 (Yosemite):

Ir a System Preferences y haga clic en Internet Accounts .

Elija una cuenta y anule la selección de Messages de la lista de aplicaciones seleccionadas.