Cómo reemplazar los archivos del sistema operativo extraviados

Sí

Simplemente coge el disco de instalación original que venía con el Mac y vuelve a instalar OSX, después sólo tienes que hacer una actualización del sistema para ponerlo a la última versión.

Cuando se instala OSX sobre una instalación existente, se conservan todas las configuraciones y aplicaciones, y esto debería resolver todos los problemas con el sistema operativo.

Sin embargo, como @Kyle señaló en los comentarios, los archivos movidos son sólo los archivos de cabecera utilizados para la compilación, y no debería estar afectando al sistema operativo de trabajo, y puesto que los archivos del sistema operativo real no están disponibles a través del Finder, muy poco probable que ella copió los archivos del sistema real, a menos que ella usó Terminal.

Si las aplicaciones siguen sin funcionar después de hacer esto, entonces esas aplicaciones específicas deben ser reinstaladas individualmente. El procedimiento anterior funcionará para todas las aplicaciones suministradas por Apple como parte del sistema operativo.