He encontrado una forma de hacer esto usando mkvpropedit que es parte de mkvtoolnix.

mkvpropedit "foo.mkv" -e info -s title="Este es el título"

Hay una interfaz gráfica para esta aplicación y otras instrucciones de instalación para Mac disponibles en el sitio web oficial.

La forma GUI de MKVToolNix:

1. Selecciona editor de encabezados en el menú.

2. Abre el archivo mkv.

3. En información del segmento hay un elemento título, cambia el título como desees.

4. No hay un botón de guardar, utiliza el menú principal para guardar los cambios.

Soporte de Versión macOS

Las versiones actuales de MKVToolNix requieren macOS Mojave (10.14) o una más nueva, pero versiones anteriores de MKVToolNix podrían funcionar para versiones anteriores de macOS/OS X.

A partir de v42.0.0, MKVToolNix utiliza std::optional,a lo cual requiere macOS 10.14.b

macOS High Sierra (10.13) y Sierra (10.12) deberían funcionar hasta la versión v41.0.0 "Smarra" (2019-Dic-06).

A partir de v30.0.0, MKVToolNix utiliza Qt 5.12,c lo cual requiere macOS 10.12.d

OS X El Capitan (10.11) debería funcionar hasta la versión v29.0.0 "Like It Or Not" (2018-Dic-01).

A partir de v26.0.0, el archivo "README.macOS.txt" indica que funciona solo con macOS 10.11 "El Capitan" o más nuevoe (aunque MACOSX_DEPLOYMENT_TARGET y LSMinimumSystemVersion están aún en 10.9, así que podría funcionar en Yosemite 10.10 o Mavericks 10.9).

OS X Yosemite (10.10) y Mavericks (10.9) deberían funcionar hasta la versión v25.0.0 "Prog Noir" (2018-Jul-12).

A partir de v9.7.1-build4, MACOSX_DEPLOYMENT_TARGET y LSMinimumSystemVersion están configurados en 10.9.f

OS X Mountain Lion (10.8) podría funcionar hasta la versión v9.7.1-build2 "Pandemonium" (2016-Dic-27).

A partir de v8.2.0, el archivo "README.macOS.txt" indica que funciona solo con Mac OS X 10.9 y versiones superiores, aunque LSMinimumSystemVersion aún está en 10.8.0, así que podría funcionar en Mountain Lion 10.8.

Además, MACOSX_DEPLOYMENT_TARGET no está configurado, así que debería apuntar a la versión de SO en la que se construyó. Dado que v9.7.0-build2 y v9.7.1-build2 se construyeron en Sierra 10.12, no funcionarán en Yosemite 10.10 ni en El Capitan 10.11 (aunque sí funcionarán en Mavericks 10.9 y Mountain Lion 10.8, que parecen ignorar esa restricción). Vea la discusión relevante aquí.

Como adición, se podría utilizar mkvpropedit en un script de bash para establecer el título de todos los archivos mkv en un directorio. (Dado que el nombre del archivo es el título deseado.)

#!/bin/bash

# Este script toma todos los archivos mkv en el directorio actual y establece el nombre del archivo
# (sin .mkv) como su título en los metadatos

for mkvfile in *.mkv; do
    mkvpropedit "$mkvfile" -e info -s title="${mkvfile%.mkv}"
done

Solo abre el archivo en el reproductor VLC, presiona Ctrl+I, elige los metadatos deseados, título, etc., cambia y luego en la parte inferior, haz clic en 'Guardar datos'. Eso es todo.

No se necesita ningún otro editor externo.

Descargué muuuchos archivos, muchos de los cuales tenían unos *** en su título, como extensión de otra respuesta hice mi propio script.

Cambia el título de todos los archivos .mkv en el directorio (y sus subdirectorios) mientras solicita una acción apropiada. Las acciones son "¿Mantener el nombre?[1] / ¿Escribir un nuevo nombre?[2] / ¿Usar el nombre de archivo como nombre de la película?[3]".

Quizás lo actualice más adelante en github, aquí está lo que hay por ahora:

#!/bin/sh

# Este script toma todos los archivos mkv en el directorio (sub) y establece su nombre/título de película
# Requiere tener instaladas las herramientas mkvtools (mkvpropedit) y mediainfo
#
# param1 Directorio de inicio (por defecto es el actual)
# param2 Acción predeterminada a realizar con los archivos
# (¿Mantener el nombre?[1] / ¿Escribir un nuevo nombre?[2] / ¿Usar el nombre de archivo como nombre de la película?[3])
# Tenga cuidado con param2 ya que este script no hace (en este momento) una copia de seguridad de los nombres de las películas existentes.

IFS=$'\n'; set -f

actualizarTitulo() {
    mkvpropedit "${1}" -e info -s title="${2}"
    echo " Actualizado a \"${2}\"";
}

obtenerTituloPelicula() {
    echo "$(mediainfo ${1} | grep "Nombre de la película" | sed 's/^.*: //')";
}

parsearNombreArchivo() {
    nombrearchivo=${1##*/}
    nombrearchivo=${nombrearchivo%.*}
    echo ${nombrearchivo}
}

elegirAccion() {
    f="${1}"
    nombreActual="${2}"
    accionPredeterminada="${3}"

    if [[ -n "${accionPredeterminada}" ]]; then
        ans="${accionPredeterminada}"
    else
        read -p "¿Mantener el nombre?[1] / ¿Escribir un nuevo nombre?[2] / ¿Usar el nombre de archivo como nombre de la película?[3] : " -n 1 ans
        echo
    fi

    case "${ans}" in

    1)
        echo "Manteniendo el nombre antiguo"
        ;;
    2)
        read -p "Nuevo nombre de la película: " nuevoNombre
        actualizarTitulo ${f} ${nuevoNombre}
        ;;
    3)
        actualizarTitulo ${f} ${nombreActual}
        ;;
    *)
        echo "Carácter inválido \"${ans}\""
        elegirAccion $@
        ;;
    esac
    echo
}

renombrarPeliculas() {
    for f in $(find ${1} -name '*.mkv'); do
        tituloActual="$(obtenerTituloPelicula ${f})"
        nombreActual="$(parsearNombreArchivo ${f})"

        echo "Ubicación del archivo - ${f}"
        echo "Nombre del archivo   - ${nombreActual}"
        echo "Nombre de la película - ${tituloActual}"

        elegirAccion ${f} ${nombreActual} ${2}
    done
    echo "Hecho"

}

renombrarPeliculas ${1:-$(pwd)} ${2}

unset IFS; set +f