Arranque directamente en una aplicación sin mostrar el escritorio

Si deseas abrir nuevas ventanas en pantalla completa por defecto, no conozco una manera de hacerlo en general, pero hay opciones para hacerlo en algunas aplicaciones como iTerm 2, VLC y WriteRoom.

También puedes asignar un atajo de teclado a un script como este:

tell application "Terminal"
    reopen -- abre una ventana predeterminada si no hay ninguna abierta
    set w to number of windows
end tell
tell application "System Events" to tell process "Terminal"
    if number of windows is w then -- si no hay ventanas en pantalla completa
        perform action "AXPress" of (button 1 where subrole is "AXFullScreenButton") of window 1
    end if
end tell
activate application "Terminal" -- hace que Terminal esté al frente

Para automatizar la apertura de una ventana en pantalla completa al iniciar sesión, podrías usar un script como este:

set old to window 1
tell application "Terminal"
    reopen
end tell
tell application "System Events" to tell process "Terminal"
    perform action "AXPress" of (button 1 where subrole is "AXFullScreenButton") of window 1
end tell
delay 1.5
activate old

Puedes crear un script de Apple utilizando Automator.