El uso del espacio del disco duro pasa del 96% al 100% un minuto después del reinicio

Tengo un MacBook Pro 13" de mediados de 2014 (MacBookPro11,1) con un SSD de 128 GB. Tengo muchas aplicaciones que uso que no funcionan en un disco duro externo, por lo que siempre tengo problemas de espacio. ¿Pero pasar de 5 GB a 0 en un minuto después de reiniciar? Eché un vistazo a la memoria, y sólo estoy usando 3 GB de 8 GB. Esto comenzó inmediatamente después de la última actualización a OS X Yosemite. 10.10.5.

$ df -h
Filesystem      Size   Used  Avail Capacity  iused   ifree %iused  Mounted on
/dev/disk1     112Gi  107Gi  5.1Gi    96% 27985010 1338252   95%   /
devfs          182Ki  182Ki    0Bi   100%      630       0  100%   /dev
map -hosts       0Bi    0Bi    0Bi   100%        0       0  100%   /net
map auto_home    0Bi    0Bi    0Bi   100%        0       0  100%   /home

# username at my-mac.local in ~ [16:14:51]
$ df -h
Filesystem      Size   Used  Avail Capacity  iused  ifree %iused  Mounted on
/dev/disk1     112Gi  108Gi  3.6Gi    97% 28384440 938822   97%   /
devfs          182Ki  182Ki    0Bi   100%      630      0  100%   /dev
map -hosts       0Bi    0Bi    0Bi   100%        0      0  100%   /net
map auto_home    0Bi    0Bi    0Bi   100%        0      0  100%   /home

# username at my-mac.local in ~ [16:15:21]
$ df -h
Filesystem      Size   Used  Avail Capacity  iused  ifree %iused  Mounted on
/dev/disk1     112Gi  111Gi  795Mi   100% 29119752 203510   99%   /
devfs          182Ki  182Ki    0Bi   100%      630      0  100%   /dev
map -hosts       0Bi    0Bi    0Bi   100%        0      0  100%   /net
map auto_home    0Bi    0Bi    0Bi   100%        0      0  100%   /home

Recibo alertas de que se ha alcanzado el límite de espacio en disco.

Después de reiniciar el Mac vuelve a ocurrir.