Cómo activar la ventana modal que aparece automáticamente cuando el programa necesita su atención

Los diálogos modales no son algo que se pueda garantizar que se mostrarán. El sistema operativo permite a los usuarios utilizar múltiples pantallas, múltiples escritorios virtuales, fijar aplicaciones a todas las pantallas, a ninguna pantalla o a una pantalla específica.

Centro de notificaciones es la herramienta correcta para enviar una notificación a un usuario así que yo rediseñaría tu script/tool/app para hacer uso del centro de notificaciones.

Además, sin ver algo de lo que ya tienes, es muy difícil sugerirte cómo implementar un cambio. Al igual que en Stack Overflow - si usted tiene un problema con una herramienta o un script aquí, por favor muestre su trabajo y haga una pregunta de seguimiento para explicar exactamente lo que desea que suceda y lo que tiene hasta ahora.

Aquí tienes un pequeño script de Python que puedes probar: un pequeño "script" de Python que he adaptado a partir de una breve búsqueda de SO :

import Foundation
import objc
import AppKit
import sys

note = objc.lookUpClass('NSUserNotification')
center = objc.lookUpClass('NSUserNotificationCenter')

def notify(title, subtitle, info_text, delay=0, sound=False, userInfo={}):
    notification = note.alloc().init()
    notification.setTitle_(title)
    notification.setSubtitle_(subtitle)
    notification.setInformativeText_(info_text)
    notification.setUserInfo_(userInfo)
    if sound:
        notification.setSoundName_("NSUserNotificationDefaultSoundName")
    notification.setDeliveryDate_(Foundation.NSDate.dateWithTimeInterval_sinceDate_(delay, Foundation.NSDate.date()))
    center.defaultUserNotificationCenter().scheduleNotification_(notification)

notify("AskDifferent", "you can program now", "Here we go... ", sound=True)
sys.stdout.write("Notification sent...\n")

Funciona en El Capitan sin necesidad de archivos adicionales o descargas afaik. De nuevo, hay docenas de opciones e idiomas, así que depende más de lo que quieras hacer a largo plazo y de si te sientes cómodo modificando scripts.