Sin más detalles sobre la cámara con la que disparas y el tipo de espacio de color y compresión con el que trabajas, es difícil dar respuestas definitivas a algunas de estas preguntas. Pero...
1) Sí. En general, querrás mantener tu aplicación separada de los medios. Por lo general, tienes OS X y el software de edición de tu elección instalados en la unidad interna principal del sistema. De todos modos, sería una tontería tenerlos instalados en una unidad externa.
2) La única situación en la que deberías tener la aplicación y cualquier medio en la misma unidad es cuando la única unidad que tienes es la interna y todo se almacena allí. Esto está bien para el uso doméstico, pero en una situación profesional esto limitaría el rendimiento del disco de forma prohibitiva.
3) Depende del formato al que se comprima. Todo depende de la tasa de bits. FW800 es aproximadamente 800 Mbits/segundo o 100 MB/s.
Es importante tener en cuenta que, dependiendo de la unidad, esto puede verse limitado por la velocidad de la unidad. Aunque la conexión FW800 pueda transportar 100 MB/s, es posible que la unidad no pueda leer o escribir lo suficientemente rápido como para saturarla.
Hay que pensar en los formatos a los que se va a exportar, en la rapidez con la que la máquina que se está construyendo puede codificar a esos formatos y en la velocidad de datos que produce. Eso te dará una cifra a la que aspirar.
Si se exporta HD en códec H.264 en una máquina de 2 núcleos, incluso una unidad USB 2.0 (con un máximo de ~30 MB/s) puede mantener el ritmo, así que realmente depende de lo que estés haciendo.
4) Aquí es donde realmente necesitas la mayor velocidad posible. Si tu material procede principalmente de fuentes comprimidas, como una cámara HDSLR, AVCHD o HDV, esto reducirá la cantidad de ancho de banda que necesitas. Si tienes material sin comprimir, será exponencialmente mayor.
Además, necesitas saber cuántos flujos quieres poder leer del disco al mismo tiempo durante la edición. Si calculas las tasas de bits de los formatos que vas a grabar, obtendrás un total que podrás equiparar a la velocidad de una unidad de origen.
5) Debido a las diferencias en los requisitos de velocidad que acabo de señalar, y al hecho de que durante la codificación, estarías leyendo y escribiendo en la misma unidad, diría que tu instinto es correcto aquí. Para situaciones de consumo, tener todo en una unidad está bien, sólo es más lento.
6) Probablemente se podría añadir eSATA sólo al MacPro, pero hay que echar un vistazo a Thunderbolt en su lugar. Los discos siguen siendo caros ahora mismo, pero si necesitas algo de gama MUY alta, puedes conseguir velocidades demenciales más allá de eSATA o USB 3.
7) Por unidad electrónica supongo que te refieres a un SSD. Tener un SSD como tu Mac es una gran cosa. Hace tanto por la experiencia del usuario, que si usted puede permitirse el lujo, sólo conseguirlo.
Sin embargo, lo que creo que estás preguntando es si deberías usarlo como disco de memoria temporal. Ha habido cierto debate sobre la longevidad de los SSD cuando se trata de grandes cantidades de lecturas/escrituras (que es lo que hace una unidad de scratch todo el día), así que ahora mismo probablemente diría que no es rentable como unidad de scratch.
Si te vas a comprar el iMac y quieres engañarlo, coge la configuración con el SSD + HDD interno. Utiliza el SSD para el sistema operativo y las aplicaciones, y dedica el HDD para usarlo como disco de arranque.
A partir de ahí, para los externos, tienes muchas opciones. El iMac tiene un FW800 y dos puertos Thunderbolt. Algo que no has preguntado, pero que es muy importante, es la ingesta de material. Al importar el material a la máquina, supongo que también querrás que sea lo más rápido posible.
Si tus unidades están en el bus FW800, querrás que tu lector de tarjetas esté en el bus USB para maximizar el ancho de banda disponible, es decir, leer sobre USB, escribir sobre FW800, en lugar de intentar hacer ambas cosas sobre cualquiera de los dos, reduciendo esencialmente el ancho de banda a la mitad.
Si terminas con unidades Thunderbolt, consigue un lector de tarjetas FW800, que acelerará drásticamente tu ingesta (una vez que tus tarjetas puedan seguir el ritmo). El bus Thunderbolt tiene espacio más que suficiente en esta etapa (10Gb/s) para manejar la lectura y la escritura al mismo tiempo, así que no hay que preocuparse por eso.
Otra cosa en la que deberías pensar es en las copias de seguridad. Si puedes permitirte un par de matrices Thunderbolt RAID 5 (una para el origen y otra para la exportación), hazlo. Te lo agradecerás después.
Espero haber proporcionado algunos consejos generales, pero hay muchas configuraciones que podrías montar. Realmente depende de tus necesidades. Tienes que ver en qué grabas y a qué exportas, y cómo editas, y luego hacer algunos cálculos.