Recuperar unos pocos archivos (o incluso la mayoría) de una copia de seguridad no sirve de nada. Ya no es una copia de seguridad. Yo ni siquiera intentaría recuperarme de este problema. Limpia la unidad, deja que TM empiece a hacer copias de seguridad de nuevo en ella, y anota esto como una lección aprendida.
Es fácil mantener una copia de seguridad de Time Machine. Simplemente inicia una copia de seguridad de TM en un disco diferente, y de vez en cuando intercambia las unidades. La copia de seguridad inicial todavía tomará mucho tiempo, pero cuando se gira de nuevo en una copia de seguridad de TM anterior, TM sólo tiene que copiar lo que es nuevo para esa unidad . Si puedes mantenerlos unidos, TM incluso hará la rotación por ti.
Empecé a hacer eso (mantener múltiples copias de seguridad de TM) después de perder una unidad de TM por un fallo de hardware. Entonces descubrí que es realmente conveniente para copias de seguridad fuera del sitio. TM puede actualizar un disco de copia de seguridad mucho más rápido que las otras soluciones de copia de seguridad (SuperDuper, CarbonCopyCloner).