La mejor manera de fusionar archivos mp4

Sólo necesitas ffmpeg

1. En un archivo de texto, escribe los archivos de vídeo que quieres combinar al final, aquí tienes un ejemplo:

   cat files.txt
   
   file 'file 1.mp4'
   file 'file 2.mp4'
   file 'file 3.mp4'
   file 'file 4.mp4'

Ahora abre el terminal e introduce

ffmpeg -f concat -safe 0 -i files.txt -c copy output.mp4

No especifica su sistema operativo, pero si tiene OS/X, entonces probablemente tenga iLife, entonces tiene iMovie. Fusionar todo eso con iMovie es extremadamente trivial. Sólo tienes que importar los vídeos a iMovie y componer la película final con todas las partes que quieras utilizar.

Los efectos, las transiciones y los subtítulos son un extra ;)

Sí, Quicktime puede conectar 2 Mpeg4 pero si quieres subirlos a una plataforma de vídeo como Youtube o Vimeo seguirán apareciendo como 2 vídeos y no se subirán correctamente. Deben ser "unidos" por un programa diseñado para ello. Hay 3 maneras de hacer esto que yo sepa.

1. Importar cada MP4 en un programa de edición, editarlos juntos y exportar la secuencia a Mpeg4 (si su editor tiene esta capacidad. Si no, deberá exportar a cualquier formato que su editor permita y luego codificar la secuencia en otro programa). Esto lleva mucho tiempo y habrá una pequeña pérdida de calidad dependiendo de su editor, ya que los ha codificado dos veces (en la importación y luego de nuevo en la exportación).
2. Hay aplicaciones diseñadas para unir varios Mp4, como la aplicación gratuita "MP4 Joiner". Lo harán rápidamente y funcionarán bien si los parámetros de compresión de cada Mp4 coinciden. Por ejemplo, si uno tiene una resolución de 1920 X 1080 y el otro es de 1280 X 720 o si uno fue comprimido a 4000 Kbps (Kilobytes por segundo) y el otro a 5000 Kbps o si se utilizaron diferentes códecs la aplicación no puede conectarlos.
3. Podrías utilizar un programa profesional de compresión/codificación como Sorenson Squeeze, Telestream Episode, Apple Compressor o Adobe Media Encoder y recodificar tus Mp4 a Mp4 utilizando la misma configuración. Estos son programas caros pero harán el trabajo sin pérdida de calidad. Hay otros programas que pueden hacer el trabajo por mucho menos dinero o incluso gratis como Handbrake, simplemente busca en Google Mp4 Encoders. Si usas un programa decente habrá poca o ninguna pérdida de calidad.

Bueno, llego tarde al juego, pero la mejor manera, en mi opinión, sería utilizar simplemente mp4joiner y acabar con ello.

Sólo hace una cosa, fusionar archivos mp4, y lo hace realmente bien y de forma sencilla. Además: Es gratuito y de código abierto y también funciona en Linux e incluso en Windows.