No debería tener ningún impacto en el rendimiento o la vida de la batería.
Creo que el mismo número de chips de memoria flash se utiliza en la de 32 GB y 64 GB de los modelos, sólo que en diferentes capacidades, por lo que el consumo de energía sería casi idéntica. De cualquier manera, la memoria flash requiere muy poca energía en comparación con las cosas como la pantalla y radios inalámbricas, por lo que cualquier impacto casi seguro que sería imperceptible.
Como para el rendimiento, no he visto ninguna de las métricas, pero iOS rendimiento no es muy afectada por la capacidad de los dispositivos. La posible excepción aquí es cuando tienes muy poco espacio libre, pero eso es sólo una conjetura.
Línea de fondo, yo sugeriría no preocuparme - acaba de comprar la capacidad de en base a su presupuesto y necesidades.