He estado usando la aplicación Preview para ver y comentar archivos PDF durante bastante tiempo. Puedes usar Shift-Command-A para mostrar la barra de herramientas de anotaciones. Luego puedes seleccionar la herramienta de resaltado y elegir un color (como amarillo para un color de resaltado estándar).
Curiosamente, el resaltado tiende a volverse más claro después de que guardo y vuelvo a abrir un archivo y no puedo entender por qué. Puede ser que el resaltado se haga más claro con cada Guardado repetido del documento PDF, o que los resaltados antiguos se estén volviendo más claros por alguna razón.
En otras palabras, los nuevos resaltados que creo se ven bien. E incluso después de guardar el documento parecen estar bien. Pero si miro el resaltado que hice ayer en el mismo documento (con la misma configuración exacta), esos resaltados están en un tono mucho más claro de amarillo. Esto está frustrando el propósito de resaltar el texto ya que apenas puedo decir que lo hice.
Creo que esto solo tiende a suceder en OS X Lion y puede ser un subproducto de alguna de las nuevas funciones de guardado. Si hay alguna opción para desactivar la "aclaración del resaltado"... um... líquido, entonces por favor házmelo saber. También acepto recomendaciones para un mejor método para anotar archivos PDF de manera más efectiva.