¿Cómo hacer que los alias desaparezcan cuando se elimina el archivo principal?

No, los alias son una combinación de un enlace simbólico que apunta a un lugar, así como un ID de archivo único para rastrear ese archivo en caso de que se mueva, por lo que el alias no se romperá si el archivo todavía reside en el volumen original. (el ID de archivo cambia entre volúmenes y un alias solo seguirá siendo válido si la ruta relativa es correcta si y cuando la mitad del ID de archivo se rompe por una eliminación).

Entonces, para que esto funcione, el sistema intenta activamente reconectar el alias después de eliminar el archivo original por diseño, por lo que eliminar automáticamente un alias arruinaría esa oportunidad de reconexión.

A pesar de que tu pregunta tiene mucho sentido lógico, equivale a un rediseño de lo que un alias está diseñado para hacer.

Un enlace físico es lo que debes usar si quieres que desaparezca cuando finalmente se elimina el archivo.

Realmente, un alias podría estar en un disco externo apuntando a tu disco normal. Si el externo está desconectado, entonces ese alias no se puede encontrar cuando se elimina el original