El artículo en el que ha visto las opciones no publicadas (mencionadas en su comentario) parece hablar de 10,6, por lo que creo que esta opción ha sido eliminada desde entonces.
En mi experiencia, habilitar el diario no afecta a la accesibilidad desde Linux o Windows:
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Si su disco externo está conectado a su Mac y esas otras plataformas están accediendo a sus datos a través de la red, el diario no es visible para ellos.
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Si estás conectando tu disco duro externo directamente a una máquina de Linux o Windows, necesitarán algún software (probablemente adicional) para proporcionar acceso a la unidad (no nativa) de formato extendido de MacOS... y el diario ha existido durante bastante tiempo, así que espero que la mayoría de los programas lo implementen (disculpa por el saludo a mano aquí).
Estoy de acuerdo con la respuesta de @MattDMo: Yo diría que use el valor por defecto Mac OS Extended (Journaled) si vas a usar la unidad sólo con Macs, y MS-DOS (FAT) de otra manera (lo que está bien para almacenar datos, aunque en realidad no son aplicaciones sin medidas especiales).