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Restaurado desde Time Machine pero SIN aplicaciones

Realmente desconcertado aquí. Tuve un corte de energía y el imac (27", OSX 10.8.3) no se reiniciaba/arrancaba después.
He probado a desenchufar, reiniciar, arrancar en modo seguro, borrar la PRAM, etc. No ha habido suerte, sólo la pantalla con el logotipo de Apple.
Usé el disco CD de Mountain Lion para arrancar en Disk utilities. verifiqué y reparé el disco. Dijo que estaba bien. Todavía no hay arranque / arranque sucediendo. Decidí restaurar a ayer desde Time Machine Hice esto (dos veces ahora) en alrededor de 25 horas cada restauración, y la restauración tiene mis archivos de documentos, etc, pero no hay aplicaciones disponibles por lo que nada se abre o funciona. El dock tiene una fila de símbolos de signo de interrogación en gris y la carpeta de aplicaciones no tiene básicamente nada en ella (149mb, en la carpeta /users/myname) No hay ninguna "segunda carpeta".)
No lo entiendo ya que pensaba que Time Machine hacía copias de seguridad de todo el sistema en momentos puntuales, no sólo de los archivos. Lo tenía configurado para hacer una copia de seguridad de todo el disco duro del imac de 2TB Ni idea de qué hacer ahora.
¿Alguien puede ayudar?

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Esta pregunta también se publicó en https://discussions.apple.com/message/22138652 . Basado en las respuestas, parece que /Applications/ realmente faltaba en el iMac y en las instantáneas.

También recomendaría hacer una instalación de actualización desde la partición de recuperación . Debería reemplazar las aplicaciones y otros archivos del sistema con las versiones por defecto, pero no afectar a la mayoría de los archivos o configuraciones del usuario.

Una pregunta similar donde el OP había excluido /Applications/ de las copias de seguridad:

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