La carpeta de contenedores utiliza un dispositivo de Unix llamado enlaces simbólicos. Estos enlaces son redireccionamientos a información almacenada en una carpeta diferente o en un disco duro separado de su sistema. Esto permite tener múltiples rutas a los mismos archivos y carpetas.
Algunas aplicaciones de software no pueden distinguir un enlace simbólico de un directorio válido y reportarán múltiples copias de los mismos archivos y carpetas. En realidad sólo hay una copia de los datos, pero los enlaces simbólicos permiten aplicar diferentes permisos a la aplicación o a los usuarios.
Si haces un comando ls -la desde la terminal el primer carácter del permiso será la letra l (ej. lrwxr-xr-x) los directorios comienzan con la letra d y los archivos comienzan con un guión '-' y el nombre del archivo de un enlace se verá así;
lrwxr-xr-x 1 root wheel hidden 11B Jan 10 2014 etc -> private/etc
La primera parte es el nombre del archivo/carpeta que el sistema está buscando y la parte que sigue al -> es la ruta completa a la ubicación real de los datos. (Para más detalles, consulte la página man de ls y ln).
La función es transparente para el usuario desde el buscador pero funcional para el sistema operativo.
Para más información, busque en la web sobre symlink o enlace simbólico.
P.D. Aunque un alias que se crea proporciona la misma funcionalidad, lo hace de una manera diferente y los alias no hacen una copia de seguridad correctamente.