Bien, esto es lo que hice.
Como dijo Brian Mc, revisé mis registros en /var/log/system.log. Encontré un poco de información extra. Esto es lo que dice la línea completa en el registro del sistema:
Mar 12 04:43:29 10242-MacBook-Air ddnsd[60]: [03/12/2016 04:43:29] [Emergency] [update thread] uncaught exception: easyDNS Runtime Exception
Así que me quedé como, ¡eh! ¿Qué es eso de "ddnsd"? Así que busqué en mis procesos cualquier proceso con un nombre como ddns.
Corrí
ps aux|grep ddns
El comando regresó con:
abudu_h 1142 0.0 0.2 2538864 6496 ?? S 7:24AM 0:01.27 /Users/abudu_h/Library/Application Support/easyDNS/ddnsa.app/Contents/MacOS/ddnsa
Pensé: no necesito que este programa se ejecute, ¿por qué no lo desactivo? Así que en lugar de borrarlo, lo que hice fue hacerlo no ejecutable.
cd /Users/abudu_h/Library/Application\ Support/easyDNS/
chmod -x ddnsa.app/
Y ¡hurra! Los mensajes cesaron.