Definitivamente puedes hacerlo. Pero o bien no puedes usar tu carpeta de inicio para almacenar tus datos en su mayor parte, o tienes que averiguar cómo hacer algún tipo de vudú.
Lo que hice no está soportado por Apple, pero funciona bien. Y puedes llevarlo a reparar en garantía sin problema. Así que no hay nada que te impida hacerlo.
Tengo la información que necesitaba aquí:
http://www.ransom-note-typography.com/index.php/SSD_and_Your_Home_Directory
http://www.tuaw.com/2009/05/14/tuaw-tip-moving-your-home-folder-to-another-disk-or-moving-it/
Básicamente la idea es que copies tu carpeta de usuario en un disco grande convencional. Luego instalas Lion en un nuevo SSD y creas una cuenta de usuario con el mismo nombre. Yo llamé a la unidad grande "Usuarios" y luego puse las carpetas de Inicio en su root.
Vaya a Usuarios y Grupos en Preferencias del Sistema. Haga clic con el botón derecho en la cuenta. Elija las opciones avanzadas. En el campo Directorio de inicio, hay un botón "Elegir" a la derecha. Haz clic en él y navega hasta la copia de la cuenta en la nueva unidad de usuario, y selecciónala. Reinicie. Ahora estarás usando la cuenta de usuario en la unidad convencional. Tus carpetas de Escritorio, Imágenes, Música, Descargas, Documentos, etc. están ahora en la unidad grande, pero es como si estuviera en la unidad de arranque.
Una gran ventaja es que puedes formatear tu disco de arranque y volver a conectarlo a la unidad de usuario, y no tocar tus archivos en absoluto. Y puedes clonar la unidad de usuario y no contendrá tus archivos de sistema. (O sus aplicaciones que permanecen en la unidad de arranque).
Si no está claro, pregunta y trataré de aclararlo.