¿Hay una razón válida por la que el plugin de la cámara web de Canon pide escanear mis unidades externas?

¿Instalé un malware?

No. Aunque no puedo hablar sobre la calidad del software producido (yo uso Nikon y encuentro su software mediocre, en el mejor de los casos) no es un malware que dañará tu computadora.

¿Hay una razón válida por la cual tuve que evitar manualmente la configuración de seguridad durante la instalación?

¿Hay una razón legítima por la cual esta aplicación pide escanear mis discos?

Hay muchas razones para desactivar la configuración de Seguridad y Privacidad. Una razón es que tu cámara está conectada a través de USB y se muestra como almacenamiento.

Además, es probable que el software esté haciendo un escaneo rápido para determinar qué dispositivo está conectado. Además, las tarjetas CF y SD son técnicamente dispositivos externos (incluso si se utilizan como lector de la cámara) por lo que puede estar escaneando en busca de carpetas de imágenes como /DCIM/.