Cambiar la entrada con CMD+Espacio sólo funciona en Escritorio Remoto si desactivas el atajo en MacOS. Si está habilitado, es recibido y manejado por MacOS, incluso si estás en Remote Desktop a pantalla completa en ese momento. Así, en lugar de cambiar el idioma de entrada remoto, cambia el local.
¿Hay alguna solución?
Estoy pensando en algo como "desactivar ese acceso directo del sistema en esa aplicación en particular", pero no puedo encontrar la funcionalidad ni en el MacOS, ni en Karabiner.