Lo que describes es lo esperado. Alguna explicación:
Las aplicaciones que mencionas (App Store, Contactos, Diccionario, mensajes, fotos, acciones, configuración del sistema, etc.) están incluidas en macOS. En macOS 11, 12 y 13, macOS y sus aplicaciones incluidas forman parte del volumen de sistema firmado de solo lectura que contiene todo el macOS (pero no otras aplicaciones, etc.) que hayas instalado.
El volumen de sistema firmado es exactamente el mismo en todos los Mac con la misma versión de MacOS. Que sea exactamente el mismo incluye que todas las fechas de los archivos (creación, modificación, adición) sean las mismas.
Por lo tanto, es de esperar que todos estos archivos tengan fechas relacionadas con el momento en que Apple los creó. Nada que ver con cuándo hiciste la instalación o la actualización. "Fecha de adición" puede ser particularmente preocupante, pero es la fecha en que Apple lo añadió al MacOS, que es idéntica en todos los Macs con esa versión de MacOS.
Habrá realizado la instalación, actualización o mejora unos días o semanas más tarde.