Sólo puedo hacer conjeturas, pero ¿estás realmente seguro de que quieres eliminar este dominio?
Un dominio de correo necesita un conjunto de registros "accesibles en Internet", CNAME y MX, para que su cuenta sea encontrada. Piense en esto como un puntero DNS a un sitio web.
Si descartas el dominio, estos registros se eliminarán de la "base de datos de Internet" y dejarán de existir. Dudo que esto signifique que Apple buscará activamente cualquier correo electrónico que ya haya archivado localmente - eso sería inviable - pero lo que sucederá es que todos los lazos entre su buzón existente y usted serán destruidos. No podrás volver a acceder a ellos más adelante.
Sería sensato que cualquier organización que gestione una estructura para múltiples usuarios independientes, después de destruir una cuenta, haga una limpieza posterior, no sólo eliminando las conexiones a la misma, sino también borrando su contenido. Existe la remota posibilidad de que puedan archivar esto temporalmente, pero puede que no decidan hacerlo, lo que significa que esta decisión sería definitiva.
No tengo mucha experiencia en esto, aunque recientemente he trasladado mis propios servidores de correo y este es el resultado efectivo: tras la eliminación de la cuenta antigua [parte de un traspaso en mi caso] la cuenta antigua simplemente "desaparece", inaccesible.
Si Apple dice que la base de datos de correo se borrará, créeles.