carácter de comentario zsh

Esto se debe a cómo Bash/Zsh está configurado para manejar los caracteres de comentario en shells interactivos y no interactivos.

Normalmente, los caracteres de comentario no se reconocen por defecto en los shells interactivos, por lo que este comportamiento es normal.

Del manual de referencia de Bash, Capítulo 3.1.3 - Comentarios :

En un shell no interactivo, o en un shell interactivo en el que la opción interactive_comments del comando shopt builtin una palabra que empiece por '#' hace que esa palabra y todos los caracteres restantes de esa línea sean ignorados. Un intérprete de comandos interactivo sin la función interactive_comments activada no permite comentarios. La dirección interactive_comments está activada por defecto en los shells interactivos.

La diferencia entre los shells interactivos y los no interactivos es que en los primeros la entrada y salida se realiza a través del terminal del usuario, mientras que en los segundos los comandos son asíncronos (no hay interacción). Aunque estés en un shell interactivo, cuando inicias un script, se crea un subshell no interactivo.

• Shell interactivos (capítulo 6.3)
• Entorno de ejecución de comandos (capítulo 3.7.3)

Aunque me he referido a Bash en esta respuesta, Zsh es lo mismo. Capítulo 6.7 - Comentarios se lee casi igual:

En shells no interactivos, o en shells interactivos con la opción INTERACTIVE_COMMENTS activada, una palabra que empiece por el tercer carácter del carácter histchars ('#' por defecto) hace que se ignore esa palabra y todos los caracteres siguientes hasta una nueva línea.

Si hay / había una buena razón por la que la función fue desactivada, me gustaría entender las razones.

Dudo en utilizar la palabra "desactivado", ya que es simplemente una variable de entorno que configura el entorno de ejecución; simplemente "no está activada" por defecto. No hay documentación sobre el razonamiento por el que Apple (en última instancia) optó por establecerlo.

Puedo confirmar que en otros sistemas operativos que he probado (FreeBSD y Debian), instalé Zsh (v5.8) y en ambos, el comportamiento descrito es el mismo que aquí - no está configurado. Esto apunta a una decisión de la gente de Zsh de que este era su comportamiento preferido del entorno de ejecución. Como no podemos especular por qué Apple hizo algo, es aún más difícil especular por qué Zsh hizo/no hizo algo y por qué Apple no lo modificó. Aunque probablemente es una apuesta segura que Apple simplemente siguió con los valores por defecto.